Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRC1Q96M27 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms