Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP47Q96K76 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP47Q96K76 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms