Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms