Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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