Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C11orf40Q8WZ69 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms