Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COPS9Q8WXC6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COPS9Q8WXC6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COPS9Q8WXC6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COPS9Q8WXC6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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