Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms