Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARID1BQ8NFD5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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