Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms