Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms