Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD40Q6AI12 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms