Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms