Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB6CQ53S08 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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