Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms