Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms