Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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