Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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