Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B3Q16720 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP2B3Q16720 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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