Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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