Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACKR1Q16570 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms