Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CRY1Q16526 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CRY1Q16526 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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