Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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