Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F4Q16254 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms