Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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SCN9AQ15858 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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SCN9AQ15858 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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SCN9AQ15858 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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SCN9AQ15858 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN9AQ15858 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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