Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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R3HDM1Q15032 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
R3HDM1Q15032 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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