Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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