Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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