Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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