Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms