Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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