Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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