Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XRCC4Q13426 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XRCC4Q13426 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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