Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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