Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms