Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NFX1Q12986 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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