Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms