Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms