Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms