Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms