Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMF1P82094 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMF1P82094 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms