Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPZ1P61923 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms