Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX2P52951 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX2P52951 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX2P52951 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GBX2P52951 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX2P52951 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX2P52951 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GBX2P52951 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms