Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGDP52209 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGDP52209 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGDP52209 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms