Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRCA2P51587 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms