Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms