Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1DP48730 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms