Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPZBP47756 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms