Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms