Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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