Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRATP43155 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRATP43155 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms